Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT13Q9NUP7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT13Q9NUP7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms