Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATG3Q9NT62 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATG3Q9NT62 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms