Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTL1Q9NRR1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTL1Q9NRR1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYTL1Q9NRR1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYTL1Q9NRR1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms