Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRH2

SNRK, SNF-related serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRKQ9NRH2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRKQ9NRH2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRKQ9NRH2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRKQ9NRH2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRKQ9NRH2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRKQ9NRH2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRKQ9NRH2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRKQ9NRH2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRKQ9NRH2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRKQ9NRH2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRKQ9NRH2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNRKQ9NRH2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNRKQ9NRH2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRKQ9NRH2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRKQ9NRH2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRKQ9NRH2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRKQ9NRH2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRKQ9NRH2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRKQ9NRH2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRKQ9NRH2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRKQ9NRH2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRKQ9NRH2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRKQ9NRH2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRKQ9NRH2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNRKQ9NRH2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms