Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARHGEF3Q9NR81 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF3Q9NR81 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms