Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPHNQ9NQX3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GPHNQ9NQX3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms