Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRDM10Q9NQV6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRDM10Q9NQV6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms