Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LHX9Q9NQ69 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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LHX9Q9NQ69 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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LHX9Q9NQ69 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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LHX9Q9NQ69 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LHX9Q9NQ69 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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