Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCNB1IP1Q9NPC3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms