Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GPCPD1Q9NPB8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms