Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARFGAP3Q9NP61 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms