Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRHQ9HD43 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRHQ9HD43 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRHQ9HD43 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRHQ9HD43 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRHQ9HD43 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRHQ9HD43 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRHQ9HD43 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTPRHQ9HD43 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRHQ9HD43 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRHQ9HD43 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRHQ9HD43 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRHQ9HD43 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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