Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms