Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSER2Q9H7U1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCSER2Q9H7U1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
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