Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNCQ9H7C4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms