Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPAP3Q9H6T3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms