Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00597Q9H2U6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00597Q9H2U6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms