Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP44Q9H0E7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP44Q9H0E7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP44Q9H0E7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP44Q9H0E7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP44Q9H0E7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP44Q9H0E7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP44Q9H0E7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP44Q9H0E7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP44Q9H0E7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP44Q9H0E7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP44Q9H0E7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP44Q9H0E7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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