Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTDSP1Q9GZU7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms