Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLIRPQ9GZT3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms