Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
REXO4Q9GZR2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
REXO4Q9GZR2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms