Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CRNKL1Q9BZJ0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
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