Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM55Q9BYV6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM55Q9BYV6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms