Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
YTHDF1Q9BYJ9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms