Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LRRC3Q9BY71 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC3Q9BY71 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms