Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABARAPL3Q9BY60 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GABARAPL3Q9BY60 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms