Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SCAPERQ9BY12 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SCAPERQ9BY12 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SCAPERQ9BY12 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SCAPERQ9BY12 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
SCAPERQ9BY12 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
SCAPERQ9BY12 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SCAPERQ9BY12 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SCAPERQ9BY12 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms