Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PACSIN1Q9BY11 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PACSIN1Q9BY11 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms