Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SYCP2Q9BX26 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SYCP2Q9BX26 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms