Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP58Q9BVL2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUP58Q9BVL2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms