Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
C9orf16Q9BUW7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms