Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NDUFAF3Q9BU61 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFAF3Q9BU61 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms