Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBGCP2Q9BSJ2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBGCP2Q9BSJ2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms