Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GINS3Q9BRX5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms