Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SIKE1Q9BRV8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIKE1Q9BRV8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms