Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SRSF8Q9BRL6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SRSF8Q9BRL6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms