Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EBF4Q9BQW3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms