Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SGIP1Q9BQI5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SGIP1Q9BQI5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms