Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RBM4BQ9BQ04 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms