Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms