Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SIGMAR1Q99720 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SIGMAR1Q99720 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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SIGMAR1Q99720 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SIGMAR1Q99720 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SIGMAR1Q99720 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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SIGMAR1Q99720 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SIGMAR1Q99720 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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SIGMAR1Q99720 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SIGMAR1Q99720 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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