Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRQ99707 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRQ99707 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRQ99707 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRQ99707 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRQ99707 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRQ99707 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRQ99707 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRQ99707 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRQ99707 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRQ99707 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRQ99707 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRQ99707 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRQ99707 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRQ99707 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRQ99707 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRQ99707 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRQ99707 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRQ99707 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRQ99707 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRQ99707 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRQ99707 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRQ99707 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRQ99707 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRQ99707 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRQ99707 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRQ99707 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRQ99707 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRQ99707 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRQ99707 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRQ99707 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRQ99707 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRQ99707 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRQ99707 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRQ99707 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRQ99707 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRQ99707 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRQ99707 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRQ99707 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRQ99707 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRQ99707 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRQ99707 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRQ99707 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRQ99707 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRQ99707 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRQ99707 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRQ99707 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRQ99707 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRQ99707 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRQ99707 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRQ99707 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRQ99707 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRQ99707 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRQ99707 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRQ99707 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRQ99707 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRQ99707 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRQ99707 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRQ99707 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRQ99707 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRQ99707 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRQ99707 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRQ99707 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRQ99707 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRQ99707 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRQ99707 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRQ99707 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRQ99707 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRQ99707 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRQ99707 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRQ99707 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRQ99707 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRQ99707 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRQ99707 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRQ99707 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRQ99707 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRQ99707 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRQ99707 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms