Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EIF3CQ99613 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3CQ99613 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms