Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms