Protein–RNA interactions for Protein: Q99519

NEU1, Sialidase-1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU1Q99519 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEU1Q99519 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEU1Q99519 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms