Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YME1L1Q96TA2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YME1L1Q96TA2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms