Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SMG1Q96Q15 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SMG1Q96Q15 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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