Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PNMA5Q96PV4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA5Q96PV4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms