Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CCDC115Q96NT0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms