Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM47Q96LD4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms